Fetullah Gülen'in kardeşi Salih Gülen'nin matbaasında paralel yapıya ait belgelerin saklandığı iddiasıyla başlatılan soruşturma 2'nci Ağır Ceza Mahkemesi tarafından kabul edildi.
Hakkında yakalama kararı bulunan Erzurumlu Fethullah Gülen'in 'Anayasal düzeni ortadan kaldırmaya teşebbüs etme, silahlı terör örgütü kurma veya yönetme, dini inanç ve duygularının istismarı suretiyle dolandırıcılık' suçlarından ağırlaştırılmış müebbet ve 12 yıldan 22 yıla kadar hapsi istendi. Cumhuriyet Savcısı, matbaa ortaklarından tutuklu Samih Yalçın ve yine hakkında yakalama kararı bulunan Salih Gülen'in ise 'silahlı terör örgütüne üye olmak' suçundan 10 yıla kadar hapis cezası verilmesini talep etti.